A Igreja Presbiteriana de São Joaquim é uma das mais antigas do Presbiterianismo da Norte Fluminense, sendo superada apenas pela Igreja Presbiteriana Central (centro de Campos).

Sua organização se deu na data de 19 de fevereiro de 1950.A comissão organizadora nomeada pelo Presbitério de Campos foi formada pelo Reverendo Francisco Cordeiro e o Presbítero Mario Cardoso dos Reis da IP Campos.A então Congregação pertencia a IP de Cachoeirinha.Os membros transferidos foram  no total de 28 comungantes e 23 não comungantes,que são:

Foram eleitos os 1º oficiais da nova Igreja Presbiteriana do Brasil em São Joaquim dois Presbíteros que são: João da Silva Rios e Sebastião Velasco e um  Diácono foram Antônio Corrêa da Silva.  

Foi eleito como Secretário de Atas da Assembléia o Senhor Olicio José Valentim.

Foi eleito como tesoureira a irmã Isabel Corrêa da Silva. 

Pastores que passaram no 1º ano: Reverendo Francisco Cordeiro (Atas 1,2) ; Reverendo Benjamim Cesar ( Ata 3) e o Reverendo Uzias Brito (Atas 4 a 7).

Na data de 16/06/1950 oficializou-se os 2 pontos de pregações de Valão dos Pires e Terreiro de Pedra ( Ata 03).

Na data de 16/07/1950 oficializou-se os 3 pontos de pregações nas residências dos senhores Marques, Amaro Ferraz e Macedinho (Ata 04).

Na data de 15/10/1950 Oficializou-se como Congregação o ponto de Valão dos Pires (Ata 06).

Na data de 28/10/1950 oficializou-se o ponto de pregação de Vargem Grande( Ata 13) que em 18/02/1952 tornou-se Congregação(Ata 17).

Na data de 18/05/1952 oficializou-se o ponto de pregação em morro da Onça (Ata 13).

Na data de 02/11/1952 Organizou-se a Congregação de Parati (Ata 22).

Na data de 30/11/1952 a IP de Campos solicita que a IP de São Joaquim assuma a Congregação de Guaratai.

Na data de 12/04/1953 organiza-se a SAF com 10 sócias.

Na data de 09/06/1955 organiza-se a UMP com 20 sócios.

Eis ai um pouco do inicio da nossa História tão abençoada.

                             Presb. Eliel Santana Menezes